Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms