Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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Ccdc180J3QNE4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc180J3QNE4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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