Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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