Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3336J3QMQ6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms