Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21060J3KMU4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms