Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21897J3KMP5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21897J3KMP5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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