Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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