Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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