Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms