Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem200bD3Z0P8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem200bD3Z0P8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms