Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms