Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm4787B2RUD9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms