Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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