Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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