Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms