Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtf1A2AQ19 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms