Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms