Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cldn34dA2AGU5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms