Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms