Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm2A2A7B5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms