Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt27Q9Z320 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms