Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms