Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms