Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms