Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma4Q9R1P0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms