Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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