Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms