Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms