Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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SrfQ9JM73 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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SrfQ9JM73 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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