Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms