Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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SacsQ9JLC8 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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