Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms