Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Mrpl39Q9JKF7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Mrpl39Q9JKF7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mrpl39Q9JKF7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mrpl39Q9JKF7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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