Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms