Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Yipf5Q9EQQ2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Yipf5Q9EQQ2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Yipf5Q9EQQ2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Yipf5Q9EQQ2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Yipf5Q9EQQ2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Yipf5Q9EQQ2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Yipf5Q9EQQ2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Yipf5Q9EQQ2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms