Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms