Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Chmp5Q9D7S9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp5Q9D7S9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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