Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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