Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms