Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ChtopQ9CY57 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ChtopQ9CY57 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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