Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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