Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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