Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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