Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pard3bQ9CSB4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms