Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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