Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rdm1Q9CQK3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rdm1Q9CQK3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rdm1Q9CQK3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdm1Q9CQK3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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