Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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