Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms