Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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NsmfQ99NF2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NsmfQ99NF2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NsmfQ99NF2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NsmfQ99NF2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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