Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tdrd1Q99MV1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms